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 PROTEINEER fc II 是一台将液相色谱分离的各个组分点到MALDI靶上的仪器。

本系统从纳升或毛细管液相系统中收集样品并将它们自动点在 PAC? Prespotted AnchorChip 靶板上，MALDI AnchorChip? 靶板或其它有利于一级质谱或二级质谱分析的样品靶板上。辅助溶液（例如基质溶液）可以在点样前直接与液相色谱的流出液汇合，然后与流出液一起点到MALDI靶上。

本仪器上可以先放置四块MALDI AnchorChip 靶板或其它板靶。机械臂不仅可以自动将样品点到靶板上以便测试，而且还可以用来加基质或加注清洗溶液清洗点样探针。
较大蛋白质组项目的所有相关数据，包括凝胶数据、质谱数据、处理参数、搜索结果等都由卓越的ProteinScape? 软件处理。ProteinScape? 软件支持凝胶电泳为基础的蛋白质组学，也支持液相色谱为基础的蛋白质组学，如2D-LC-MS/MS, LC-ESI, LC-MALDI以及基于二者的定量蛋白质组学，稳定同位素标记(SILE) 和非标记的方法等。